Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmeff1Q6PFE7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms