Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms