Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms