Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcncQ62447 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms