Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ss18Q62280 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms