Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcp1Q61233 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms