Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamb3Q61087 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamb3Q61087 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms