Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ankrd40Q5SUE8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms