Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc3Q5DU56 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms