Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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