Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig2Q52KR2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig2Q52KR2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms