Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacs2Q3V3Q7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms