Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc160Q3UYG1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms