Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clpsl2Q3UW21 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms