Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm29609Q3UU56 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm29609Q3UU56 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms