Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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