Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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