Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms