Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smu1Q3UKJ7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Smu1Q3UKJ7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms