Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmod2Q3UHZ5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms