Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Puf60Q3UEB3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Puf60Q3UEB3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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