Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssbp4Q3U4B1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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