Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc174Q3U155 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc174Q3U155 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms