Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dcaf17Q3TUL7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms