Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms