Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp2Q06649 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms