Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox13Q04891 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms