Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox8Q04886 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms