Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjb4Q02738 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjb4Q02738 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms