Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sec23aQ01405 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sec23aQ01405 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms