Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prop1P97458 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prop1P97458 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prop1P97458 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prop1P97458 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms