Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms