Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms