Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms