Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms