Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr4P70658 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms