Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shox2P70390 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shox2P70390 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms