Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Traf5P70191 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms