Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P58686 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P58686 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P58686 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P58686 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P58686 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P58686 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
P58686 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
P58686 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P58686 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P58686 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P58686 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P58686 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P58686 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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