Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NcstnP57716 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NcstnP57716 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms