Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtskP55097 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtskP55097 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms