Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pms2P54279 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms