Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt6aP50446 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms