Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms