Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NapbP28663 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NapbP28663 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NapbP28663 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NapbP28663 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NapbP28663 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NapbP28663 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NapbP28663 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NapbP28663 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NapbP28663 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NapbP28663 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NapbP28663 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NapbP28663 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NapbP28663 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NapbP28663 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms