Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjc1P28229 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjc1P28229 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms