Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgat1P27808 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms