Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klra1P20937 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms