Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nid1P10493 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nid1P10493 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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