Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01656 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01656 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01656 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01656 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01656 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01656 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01656 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01656 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01656 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01656 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01656 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01656 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01656 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms